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## 1、 基因ID轉換工具 https://hum-molgen.org/NewsGen/08-2009/000020.html ## 2、 the known binding sites of all TFs R 包 MotifDb： https://github.com/PriceLab/Mo 閱讀全文
posted @ 2021-06-14 13:51
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這些年，陸陸續續收到不少小伙伴問我怎么在文章中致謝我，給個統一模板： We thank the blogger (orange_milk_sugar, Wenyan Chen) for XXX XXX 部分請自由發揮。 閱讀全文
posted @ 2021-06-03 21:54
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1. 人類基因組轉錄起始位點 TSS http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/current/human/refTSS_v3.1_human_coordinate.hg38.bed.gz http://reftss.clst.riken.jp/datafiles/ 閱讀全文
posted @ 2021-06-02 22:53
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時隔一年多，于今日（20210313）再次更新教程，后續如果新出教程的話會一直更新。 同時感謝多年陪伴我成長、一直默默關注我的**「你們」**~ by 「橙子牛奶糖（陳文燕）」 1.前言 很多人問我有沒有關于全基因組關聯分析（GWAS）原理的書籍或者文章推薦。 其實我個人覺得，做這個分析，先從跑流程 閱讀全文
posted @ 2019-11-06 09:49
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1、列表包括數據庫名稱、表型、是否能下載到基因型（genotype）、是否能下載到GWAS結果文件（P值、效應值、SNP位點）。目前收集到的有如下： 參考到這些數據庫的文獻：Genome-wide association study identifies 74 loci associated wit 閱讀全文
posted @ 2018-04-28 20:03
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文章標題：A pangenome of maize provides genetic insights into drought resistance 中文標題：破譯玉米抗旱密碼！構建超級泛基因組揭示關鍵基因 關鍵詞：玉米、泛基因組、干旱脅迫、結構變異、基因功能 摘要總結：干旱是全球農業生產面臨的嚴 閱讀全文
posted @ 2025-11-04 19:51
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文章一 文章標題: A pangenome and pantranscriptome of hexaploid oat 中文標題: 泛基因組圖譜助力燕麥育種改良 關鍵詞: 六倍體燕麥、泛基因組、泛轉錄組、結構變異、作物育種 摘要總結: 這篇文章通過構建33個野生和栽培燕麥品系的染色體級別高質量泛基因 閱讀全文
posted @ 2025-10-31 20:41
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1. Tracking clonal evolution during treatment in ovarian cancer using cell-free DNA 中文標題: cfDNA揭秘卵巢癌耐藥演化：從診斷到復發，精準追蹤克隆動態 關鍵詞: 卵巢癌、克隆演化、cfDNA、耐藥性、精準治療 閱讀全文
posted @ 2025-10-12 11:43
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1. Single-cell multi-omic and spatial profiling of esophageal squamous cell carcinoma reveals the immunosuppressive role of GPR116+ pericytes in cance 閱讀全文
posted @ 2025-10-11 22:23
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Multiancestry brain pQTL fine-mapping and integration with genome-wide association studies of 21 neurologic and psychiatric conditions 中文標題： 多祖先腦蛋白遺傳調 閱讀全文
posted @ 2025-09-15 23:14
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Molecular subtypes of human skeletal muscle in cancer cachexia 中文標題： 破解癌癥惡病質肌肉謎團！整合RNA組學揭示兩大分子亞型預示預后 關鍵詞： 癌癥惡病質、分子亞型、RNA組學、非負矩陣分解、肌肉萎縮 摘要總結： 這篇文章通過高通量 閱讀全文
posted @ 2025-09-12 17:10
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關鍵詞 肺癌、克隆拷貝數、ALPACA方法、染色體不穩定性、生存預后 摘要總結 這篇文章是2025年8月發表在《Nature》雜志上的一篇研究，標題為“Clone copy number diversity is linked to survival in lung cancer”。這篇文章通過開發 閱讀全文
posted @ 2025-09-02 22:49
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網絡圖大家應該不陌生，Gene Ontology，PPI等經常會用到網絡圖。比如下圖是大家熟悉的Gene Ontology網絡圖: 今天教大家怎么用cytoscape繪制高級的網絡圖 1. 導入數據 下載、安裝Cytoscape（https://cytoscape.org/）。 安裝完畢后打開cyt 閱讀全文
posted @ 2025-09-02 10:31
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使用命令BiocManager::install("GenomeInfoDbData")安裝R包時，出現報錯：'getOption("repos")' replaces Bioconductor standard repositories, see 'help("repositories", pac 閱讀全文
posted @ 2025-08-18 23:13
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關鍵詞 抑郁癥、單核染色質開放性、興奮性神經元、灰質微膠細胞、遺傳風險變異位點 摘要總結 這篇文章是2025年8月發表在《Nature Genetics》雜志上的一篇研究，標題為“Single-nucleus chromatin accessibility profiling identifies 閱讀全文
posted @ 2025-08-13 13:45
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