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      工作站centos系統的安裝---網卡驅動問題

      摘要: 問題:安裝centos7后,怎么配置網絡,都不行,鏈接不上。 問題解決: 1. 安裝好centos7 64位桌面版后(其他版本同樣適用),執行 # ifconfig,查看沒有相應的網卡信息,說明網卡驅動的信息沒有。 2. 查看網卡驅動型號。 # lspci | grep -i ethernet 顯示 閱讀全文
      posted @ 2020-11-21 01:29 原生態 閱讀(1934) 評論(0) 推薦(0)

      基因或蛋白富集分析,gsea與ssgsea

      摘要: 大家應該對通路富集分析都很熟悉,如DAVID、超幾何富集分析等。都是在大量文章中常見的通路富集方法,給大家介紹一個更加復雜的通路富集分析的前期數據處理包GSVA(gene set variation analysis)與gsea選擇。GSVA是一種非參數的無監督分析方法,主要用來評估芯片核轉錄組的基 閱讀全文
      posted @ 2020-07-05 12:40 原生態 閱讀(11305) 評論(0) 推薦(0)

      UniProt數據庫怎么看

      摘要: 由于蛋白質組學的發展,使得蛋白質數據庫也日益豐富,數據庫的專一性及綜合性均增強,而且,通過超文本的鏈接,可以使多個數據庫進行相互的銜接。目前,關于蛋白質的結構,蛋白質質譜等數據庫均較多,今天就來講講使用頻率最高且冗余度最低的uniprot數據庫。 拿到蛋白質組學鑒定結果后,看懂數據庫當然是第一步的。 閱讀全文
      posted @ 2020-06-21 18:32 原生態 閱讀(3240) 評論(0) 推薦(1)

      蛋白組學之外泌體

      摘要: 1. 外泌體研究背景: 胞外囊泡是從細胞膜上脫落或者由細胞分泌的具有雙層膜結構的囊泡狀小體,主要由微囊泡、凋亡小體、外泌體組成。而外泌體是其中一類小囊泡,直徑為30~150nm,密度1.10~1.18 g/ml,可攜帶核酸、蛋白質質和脂質等,存在于血液、唾液、尿液等多種體液中。 越來越多的研究證實, 閱讀全文
      posted @ 2020-03-26 11:09 原生態 閱讀(2853) 評論(0) 推薦(1)

      蛋白組學定量值得比較說明

      摘要: 1. Maxquant的iBAQ和LFQ,該用哪個?我們使用Maxquant做Label Free蛋白質組學定量分析的時候,在Maxquant的參數設置時,會遇到兩個參數,LFQ和iBAQ,那么,選擇哪個好呢?如果你都選上,在最終的proteingroups.txt中,會出現三列:Intensity 閱讀全文
      posted @ 2019-10-21 13:04 原生態 閱讀(19042) 評論(0) 推薦(2)

      Significance A and B for protein ratios

      摘要: 實驗設計中,一般會做三個生物學重復來確保結果的準確性,尤其在下游分析中。但有時會遇到沒有生物學重復,而又需要進行差異分析的情況,這時一般建議考慮foldchange即可,因為根本無法進行T-test等統計學方法嘛。但是如果必須要算一個P值(個人覺得沒啥必要。。。),那么不同組學有各自處理的方法(雖然 閱讀全文
      posted @ 2019-05-04 22:04 原生態 閱讀(1527) 評論(0) 推薦(0)

      論壇網頁的制作

      摘要: Crossday Discuz! Board(簡稱 Discuz!)是北京康盛新創科技有限責任公司推出的一套通用的社區論壇軟件系統。自2001年6月面世以來,Discuz!已擁有15年以上的應用歷史和200多萬網站用戶案例,是全球成熟度最高、覆蓋率最大的論壇軟件系統之一。 利用Discuz構建社區論 閱讀全文
      posted @ 2017-08-11 16:38 原生態 閱讀(1019) 評論(0) 推薦(0)

      Linux下BLAST的使用---轉載

      摘要: 1、把BLAST的壓縮文件解壓,然后將bin目錄下的文件拷貝至/usr/local/bin下;2、制作軟鏈接,將解壓后的文件中bin目錄鏈接至/home/username下,eg:ln -s /home/username/blast/bin;3、在當前用戶目錄下,編輯bashrc文件,在文件中加入e 閱讀全文
      posted @ 2016-09-27 17:23 原生態 閱讀(2783) 評論(0) 推薦(0)

      基因組測序、組裝與分析總結

      摘要: 1. 測序前的準備 搜集物種相關信息,比如基因組大小,雜合度, 1.1 獲取基因組大小 基因組大小的獲取關系到對以后組裝結果的大小的正確與否判斷;基因組太大(>10Gb),超出了目前denovo組裝基因組軟件的對機器內存的要求,從客觀條件上講是無法實現組裝的。 一般物種的基因組大小可以從(http: 閱讀全文
      posted @ 2016-09-26 15:59 原生態 閱讀(2072) 評論(0) 推薦(0)

      linux 定時備份

      摘要: 每部主機的任務都不相同,重要的數據也不相同,重要性也不一樣,因此,每個人癿備份思考角度都不一樣! 有些備份策略是非常有趣的;(1)掛載儲存設備進行備份:掛載設備:備份的 script #!/bin/bash # ############################################... 閱讀全文
      posted @ 2015-09-20 17:07 原生態 閱讀(290) 評論(0) 推薦(0)
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