Freesurfer一些常用代碼
以下代碼的功能是:基于存儲在“Caculating”文件夾下的多個受試者的T1結構像,使用Freesurfer做recon-all處理(非并行)。
#!/usr/bin/env bash export SUBJECTS_DIR=/yourpath/brain_models for subj in `ls /yourpath/brain_models/Caculating` do recon-all -s $subj -i /yourpath/brain_models/Caculating/$subj/*.nii.gz -all -qcache done