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      Freesurfer一些常用代碼

       以下代碼的功能是:基于存儲在“Caculating”文件夾下的多個受試者的T1結構像,使用Freesurfer做recon-all處理(非并行)。

      #!/usr/bin/env bash
      export SUBJECTS_DIR=/yourpath/brain_models
      for subj in `ls /yourpath/brain_models/Caculating`
      do
              recon-all -s $subj -i /yourpath/brain_models/Caculating/$subj/*.nii.gz -all -qcache  
      done

       

      posted @ 2024-12-08 04:35  wangsl97  閱讀(142)  評論(0)    收藏  舉報
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