背景

近期在處理fMRI數(shù)據(jù)，在此記錄一些常用數(shù)據(jù)處理軟件、工具及說明文件，便于隨時查找。

1、Rest plus

包括數(shù)據(jù)處理的pipeline，以及各種繪圖功能。安裝方法：直接下載安裝包并解壓到當(dāng)前文件夾，移動至MATLAB的toolbox文件夾，并設(shè)置路徑，在命令行輸入“restplus”即可調(diào)出界面。

軟件包下載鏈接：http://www.restfmri.net/forum/sites/default/files/200902_1511_RESTplus_v1.24.tar.gz

Manual：http://www.restfmri.net/forum/sites/default/files/RESTplus%20V1.21%20Manual.pdf

2、Conn

同樣包括數(shù)據(jù)處理的pipeline，以及各種繪圖功能。特點是做功能連接分析。安裝方法：直接下載安裝包并解壓到當(dāng)前文件夾，移動至MATLAB的toolbox文件夾，并設(shè)置路徑，在命令行輸入“conn”即可調(diào)出界面。

軟件包下載鏈接：https://www.nitrc.org/projects/conn/

3、Cat12

主要是用于腦部疾病的VBM分析，處理多種結(jié)構(gòu)像數(shù)據(jù)。

軟件包下載鏈接：http://www.neuro.uni-jena.de/cat/index.html#DOWNLOAD

Manual：http://www.neuro.uni-jena.de/cat12/CAT12-Manual.pdf

4、AFNI

同樣包括數(shù)據(jù)處理的pipeline，以及各種繪圖功能。個人主要用于統(tǒng)計分析。

官網(wǎng)鏈接：https://afni.nimh.nih.gov/

Manual：https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/doc/doc/program_help/

培訓(xùn)材料：https://afni.nimh.nih.gov/pub/dist/edu/2007_02_korea/afni_pdf_handouts/

中文版教程：https://max.book118.com/html/2016/0421/40991686.shtm

5、SPM Anatomy Toolbox

主要是用于roi的定義與提取。

軟件下載鏈接：https://www.fz-juelich.de/SharedDocs/Downloads/INM/INM-7/EN/SPM_Toolbox/Toolbox_22c.html

根據(jù)學(xué)習(xí)進度，后續(xù)會繼續(xù)補充相關(guān)內(nèi)容。