在生物醫(yī)藥研發(fā)中,“從海量分子里找到能精準(zhǔn)結(jié)合靶標(biāo)的那一個”,是很多實(shí)驗(yàn)的核心目標(biāo)。而噬菌體展示技術(shù),正是憑借 “基因與分子綁定 + 多輪篩選富集” 的設(shè)計(jì),成為解決這一問題的經(jīng)典工具。它的原理看似復(fù)雜,實(shí)則每一步都圍繞 “精準(zhǔn)” 展開 —— 從外源分子與噬菌體外殼的融合表達(dá),到 “吸附 - 洗脫 - 擴(kuò)增” 的循環(huán)篩選,最終實(shí)現(xiàn)特異性分子的高度富集。今天就拆解這項(xiàng)技術(shù)的核心邏輯,讓你搞懂它為什么能從百萬級庫中 “揪出” 目標(biāo)分子。
噬菌體展示技術(shù)的關(guān)鍵,是給噬菌體 “裝上定制外殼”—— 通過基因工程手段,把編碼多肽、蛋白質(zhì)的外源基因(或目的基因片段),精準(zhǔn)插入到噬菌體外殼蛋白的結(jié)構(gòu)基因中。這個過程有兩個核心要求:
一是 “閱讀框正確”,簡單說就是外源基因的序列要和外殼蛋白基因 “拼接無誤”,確保翻譯時能合成完整的融合蛋白;二是 “不影響外殼功能”,外源基因插入的位置不能破壞外殼蛋白的組裝能力,保證噬菌體還能正常形成子代顆粒。
當(dāng)噬菌體在宿主細(xì)胞(通常是大腸桿菌)內(nèi)復(fù)制時,外源基因會跟著外殼蛋白基因一起表達(dá),形成 “外殼蛋白 + 外源分子” 的融合蛋白。這些融合蛋白會隨著子代噬菌體的組裝,自然展示在噬菌體表面 —— 相當(dāng)于噬菌體 “既攜帶了外源基因(基因型),又展示了外源分子(表型)”。
更重要的是,展示在噬菌體表面的外源分子(多肽或蛋白質(zhì)),能保持相對獨(dú)立的空間結(jié)構(gòu)和生物活性。這一點(diǎn)至關(guān)重要:如果分子結(jié)構(gòu)變形、活性丟失,就無法與靶標(biāo)結(jié)合,后續(xù)篩選也就無從談起。而噬菌體展示技術(shù)恰好解決了這個問題,讓外源分子能以 “天然狀態(tài)” 參與后續(xù)反應(yīng)。
有了展示外源分子的噬菌體庫(比如肽庫),下一步就是通過 “吸附 - 洗脫 - 擴(kuò)增” 的循環(huán),從海量噬菌體中篩選出能結(jié)合靶標(biāo)的 “目標(biāo)分子”。這個過程就像用漏斗層層過濾,每一輪都淘汰無效噬菌體,富集特異性噬菌體,通常 3-5 輪就能達(dá)到理想效果。
先把固相載體(比如酶標(biāo)板、磁珠)上的靶蛋白(或其他靶分子)與噬菌體庫一起孵育。孵育的目的很簡單:讓噬菌體表面展示的外源分子,有足夠時間與靶標(biāo)結(jié)合 —— 能結(jié)合的噬菌體就會 “粘” 在固相載體上,不能結(jié)合的則游離在溶液中。
這一步的關(guān)鍵是 “孵育條件適配”:比如溫度(通常室溫或 4℃,避免分子變性)、孵育時間(根據(jù)靶標(biāo)親和力調(diào)整,一般 1-2 小時)、緩沖液成分(保持分子活性),這些條件都會影響結(jié)合效率,需要根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求優(yōu)化。
孵育結(jié)束后,首先要洗去未結(jié)合的游離噬菌體 —— 這一步相當(dāng)于 “初步過濾”,用緩沖液反復(fù)沖洗固相載體,把那些沒有與靶標(biāo)結(jié)合的、非特異性吸附的噬菌體徹底沖掉,只留下真正結(jié)合靶標(biāo)的噬菌體。
接下來是 “特異性洗脫”:用兩種常見方法把結(jié)合的噬菌體從靶標(biāo)上 “摘” 下來 —— 要么用 “競爭受體”(比如過量的游離靶標(biāo)分子,與噬菌體競爭結(jié)合位點(diǎn),把噬菌體 “擠” 下來),要么用 “酸洗脫”(比如 pH2.2 的甘氨酸 - HCl 緩沖液,通過改變 pH 破壞噬菌體與靶標(biāo)的結(jié)合鍵)。洗脫下來的噬菌體,就是這一輪篩選的 “候選者”。
洗脫下來的噬菌體數(shù)量通常很少,無法直接用于下一輪篩選,所以需要 “擴(kuò)增”:把洗脫的噬菌體感染大腸桿菌,利用噬菌體的高復(fù)制能力,在宿主細(xì)胞內(nèi)快速繁殖,產(chǎn)生大量子代噬菌體。這些擴(kuò)增后的噬菌體,會作為下一輪篩選的 “起始庫”。
為什么需要 3-5 輪循環(huán)?因?yàn)榈谝惠喓Y選后,特異性噬菌體的比例可能還很低,非特異性結(jié)合的噬菌體沒有被完全淘汰;每多一輪 “吸附 - 洗脫 - 擴(kuò)增”,特異性噬菌體的比例就會大幅提升 —— 比如第一輪可能只有 1% 的特異性噬菌體,經(jīng)過 3 輪后,比例能提升到 90% 以上,實(shí)現(xiàn) “高度富集”。
經(jīng)過多輪篩選后,得到的噬菌體制劑里,大部分都是能與靶標(biāo)特異結(jié)合的噬菌體。這些噬菌體有兩個核心用途:
一是 “進(jìn)一步富集”,如果需要更高親和力、更特異的分子,可以基于這些噬菌體繼續(xù)優(yōu)化篩選條件,做更多輪篩選;二是 “獲取目標(biāo)分子”,提取這些噬菌體的 DNA 測序,就能得到外源分子(多肽或蛋白質(zhì))的基因序列,后續(xù)通過基因工程手段表達(dá)、純化,就能得到可用于實(shí)驗(yàn)或研發(fā)的目標(biāo)分子。
正是這種 “精準(zhǔn)篩選 + 高效富集” 的特性,讓噬菌體展示技術(shù)成為生物醫(yī)藥領(lǐng)域的 “通用工具”—— 不管是篩選靶向腫瘤的多肽藥物、開發(fā)診斷試劑的抗體片段,還是研究蛋白 - 蛋白相互作用,它都能發(fā)揮作用,成為從基礎(chǔ)研究到產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)化的關(guān)鍵橋梁。
泰克生物依托成熟的噬菌體展示技術(shù)體系,為客戶提供從噬菌體庫構(gòu)建(肽庫、抗體庫)到 “吸附 - 洗脫 - 擴(kuò)增” 全流程篩選服務(wù),確保每一輪篩選都能高效富集特異性噬菌體,助力科研與藥物研發(fā)需求。