噬菌體展示技術(shù)的本質(zhì)是 “將分子的‘基因型’(噬菌體 DNA 中的外源基因)與‘表型’(噬菌體表面展示的外源蛋白)綁定”,通過三輪核心循環(huán)完成特異分子的篩選,流程可概括為:
- 吸附:將靶分子(如抗體、受體蛋白)固定在固相載體(如聚乙烯平皿)上,加入噬菌體展示庫(含 10?-10?種不同外源分子的噬菌體)—— 僅能與靶分子特異性結(jié)合的噬菌體,會(huì)通過蛋白互作吸附在載體表面,未結(jié)合的游離噬菌體則留在溶液中;
- 洗脫:用酸性溶液或競(jìng)爭配體洗去非特異性結(jié)合的噬菌體,只保留與靶分子高親和力結(jié)合的克隆;
- 擴(kuò)增:將洗脫的特異噬菌體感染大腸桿菌,利用細(xì)菌快速繁殖實(shí)現(xiàn)噬菌體擴(kuò)增,獲得足量的特異克隆。
經(jīng)過 3-5 輪循環(huán),特異噬菌體的比例可從初始的百萬分之一富集到 90% 以上,最終通過測(cè)序即可直接獲得外源分子的編碼序列,實(shí)現(xiàn) “篩選即得序列” 的高效性。
根據(jù)噬菌體類型的差異,噬菌體展示系統(tǒng)分為三類,核心區(qū)別在于 “用于融合外源分子的外殼蛋白” 不同,直接決定了其適用的外源分子大小、分泌需求與應(yīng)用場(chǎng)景:
以 “次要外殼蛋白 PⅢ” 和 “主要外殼蛋白 PⅧ” 為核心融合位點(diǎn),適配抗體片段、短肽篩選:
- PⅢ 展示系統(tǒng):PⅢ 位于噬菌體尾端(每顆粒 3-5 個(gè)拷貝),外源分子可融合在其信號(hào)肽與功能區(qū)之間,不影響噬菌體感染性。優(yōu)勢(shì)是支持較大分子(如 scFv 抗體片段、50kDa 以內(nèi)蛋白)的展示,且可通過輔助噬菌體實(shí)現(xiàn) “單價(jià)展示”(每噬菌體僅展示 1 個(gè)外源分子),避免多價(jià)結(jié)合導(dǎo)致的假陽性,是抗體篩選的首選系統(tǒng);
- PⅧ 展示系統(tǒng):PⅧ 是噬菌體主要外殼蛋白(每顆粒 2700 個(gè)拷貝),僅能融合短肽(≤5 個(gè)氨基酸)—— 較大分子會(huì)阻礙噬菌體裝配,但加入輔助噬菌體提供野生型 PⅧ 后,可展示稍長肽段,適合構(gòu)建隨機(jī)短肽庫(如篩選抗原線性表位)。
λ 噬菌體在細(xì)菌內(nèi)完成裝配,無需跨膜分泌,解決了 “真核蛋白因分泌困難無法展示” 的痛點(diǎn),核心融合位點(diǎn)為 PV 蛋白與 D 蛋白:
- PV 展示系統(tǒng):PV 構(gòu)成噬菌體尾部管狀結(jié)構(gòu),外源分子可插入其 C 端非功能區(qū),已成功展示 120kDa 的植物外源凝血素 BPA(傳統(tǒng)系統(tǒng)難以實(shí)現(xiàn)),每噬菌體平均展示 1 個(gè)外源分子,避免多價(jià)干擾;
- D 蛋白展示系統(tǒng):D 蛋白參與噬菌體頭部裝配,外源分子融合后,可通過宿主抑制 tRNA 活性調(diào)控融合蛋白比例 —— 這一特性對(duì)展示 “可能干擾噬菌體裝配的毒性蛋白” 尤為重要,且支持體內(nèi)外雙重裝配模式。
T4 噬菌體的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)是 “可同時(shí)展示兩種外源分子”,且能形成無 DNA 的空衣殼,生物安全性高:
- 利用外殼蛋白 SOC(9kDa)和 HOC(40kDa)的表面暴露區(qū)域融合外源分子,兩者均不影響噬菌體生存繁殖,可同時(shí)展示抗原表位與佐劑分子;
- 當(dāng) DNA 包裝被抑制時(shí),T4 可形成不含基因組的空衣殼(SOC 和 HOC 仍正常裝配),這種空衣殼展示抗原時(shí),無需擔(dān)心病毒 DNA 整合風(fēng)險(xiǎn),在新型疫苗研發(fā)中極具潛力(如展示肉毒梭菌中和表位的空衣殼,免疫小鼠可產(chǎn)生高滴度特異性抗體)。
噬菌體展示技術(shù)的優(yōu)勢(shì)在 “靶標(biāo)結(jié)合分子篩選” 與 “表位研究” 中尤為突出,具體應(yīng)用包括:
- 抗原表位鑒定:通過篩選隨機(jī)肽庫,可快速確定抗體識(shí)別的線性或構(gòu)象表位 —— 例如已成功解析 HIV、HBV、HCV 病毒抗原的表位,甚至找到 “模擬表位”(與天然表位序列不同,但能誘發(fā)相同免疫反應(yīng)),為疫苗設(shè)計(jì)提供精準(zhǔn)靶點(diǎn);
- 抗體 / 配體篩選:從噬菌體抗體庫中篩選全人源抗體(如阿達(dá)木單抗),或篩選受體的特異性配體,避免傳統(tǒng)雜交瘤技術(shù)依賴動(dòng)物免疫、免疫原性高的缺點(diǎn);
- 新型疫苗研發(fā):利用 T4 噬菌體空衣殼或絲狀噬菌體的免疫原性(無需佐劑即可誘導(dǎo)抗體),展示病原體抗原表位,構(gòu)建安全高效的疫苗候選物。
- 高通量:單輪篩選可處理 1011 PFU 的噬菌體庫,快速富集特異分子;
- 易純化:絲狀噬菌體可分泌到培養(yǎng)基中,通過離心 + 沉淀即可富集,無需復(fù)雜蛋白純化步驟;
- 模擬表位篩選:可獲得天然表位的替代分子,解決 “天然表位難以表達(dá)” 的問題。
- 庫容限制:常規(guī)文庫庫容上限為 10?,難以覆蓋超大分子的序列多樣性;
- 表達(dá)限制:真核蛋白因折疊機(jī)制與細(xì)菌不同,易在噬菌體中表達(dá)失敗或降解;
- 毒性分子難題:對(duì)細(xì)菌有毒性的分子(如生物毒素)難以有效展示。
盡管存在局限,噬菌體展示技術(shù)憑借 “基因型 - 表型統(tǒng)一”“高效篩選” 的核心優(yōu)勢(shì),仍是生物醫(yī)學(xué)研究中不可或缺的工具。隨著文庫構(gòu)建技術(shù)(如高轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞提升庫容)、真核蛋白展示優(yōu)化的發(fā)展,這項(xiàng)技術(shù)將在抗體藥物、疫苗研發(fā)、分子診斷等領(lǐng)域持續(xù)發(fā)揮更大價(jià)值。
泰克生物提供噬菌體展示技術(shù)全流程支持,涵蓋展示庫構(gòu)建、靶標(biāo)結(jié)合篩選及陽性克隆鑒定,助力抗原表位研究與抗體 / 配體開發(fā)。