脫靶網站CHOPCHOP

1.脫靶網站CHOPCHOP

CHOPCHOP是用于設計基因敲除用sgRNA，還可以用來設計基于CRISPR的基因激活、沉默等，同時也是針對多種物種的。

首先在官網界面，輸入基因名字或Fasta序列，選擇相應的物種，然后點擊運行即可搜尋候選的sgRNA

以5593為例：輸入基因名字、選擇芝麻物種

結果界面：

選擇排名第一的：TTGTGACGGAATGAGACGGGCGG

根據文件設計引物：

F:ATTGTTGTGACGGAATGAGACGGGCGG

R:AAACCCGCCCGTCTCATTCCGTCACAA

TTGTGACGGAATGAGACGGGCGG

CCGCCCGTCTCATTCCGTCACAA