摘要： 準備在工作站搭建一個宏轉錄組的分析流程了～先占個坑 閱讀全文

摘要： 1、必做：在終端中運行下面命令，安裝編譯 R 包常用的依賴： sudo apt updatesudo apt install -y \ libcurl4-openssl-dev \ libssl-dev \ libxml2-dev \ libnlopt-dev \ libgsl-dev \ buil 閱讀全文

摘要： 非常棒的教程~https://indexofire.github.io/pathongs/book/main/ PulseNet（病原菌分子分型監測網絡）是美國CDC于1998年5月由副總統在白宮宣布成立的，這個網絡是利用標準化的細菌實驗室分子分型技術、通過分布各地的網絡實驗室的實際檢測和監測，建立 閱讀全文

摘要： 打開終端并進入需要運行 JupyterLab 的目錄。 輸入 nohup jupyter lab & 命令并按下回車鍵，這將在后臺運行 JupyterLab，并將輸出信息寫入到 nohup.out 文件中。 在使用 nohup 命令啟動 JupyterLab 后，用戶需要自己管理 JupyterLa 閱讀全文

摘要： 1.先把網址甩上來~jupyterlab超大手冊https://jupyterlab.readthedocs.io/en/stable/getting_started/installation.html 2.jupter是iPython內核的，想用r，得加個r內核： 先在ubuntu里裝個R，怎么裝 閱讀全文

摘要： 先來一點超級教程吧：https://www.liaoxuefeng.com/wiki/896043488029600 讓chatgpt來怒答一下~ 1. 云服務器連接到github 在新服務器上安裝Git （騰訊云安裝了）： sudo apt-get update sudo apt-get inst 閱讀全文

摘要： 1. 某寶騰訊云服務器公測版一年425大洋，4核8g+180g的ubuntu 22.04版本，足夠用了。 2.不用換下載源，灰常方便。 3.騰訊云官網設置了ssh登錄，私鑰保存到本地(.pem)。在mobaxterm上登陸ssh，advance導入私鑰即可，不用記密碼，方便。 4.更新先： sudo 閱讀全文

摘要： 這一篇范例呢，比較簡單，直接來看circos plot這條記錄。 一.Karyotype 選擇的是2號文件，一共24條染色體： 2D Data Tracks，Link Tracks，Ideogram，ticks都沒有設置，在General板塊，將圖片的背景色設置為黑色。 二.重點就是Hightlig 閱讀全文

摘要： 這里我們要用galaxy plot畫多個圖； 可以看到有103條記錄，其中多條記錄都沒有顯示，可以點擊右上角的設置圖標，選擇”取消隱藏的數據集“，就可以看到其他記錄了。 從第1條記錄Karyotype.txt中我們可以看到我們一共要畫24條染色體，這次我們不將它們統一并列放在最外圈，而是一個染色體做 閱讀全文

摘要： 今天來記錄galaxy circos給出的第二個例子：Cancer Genomics & Chromothripsis。跟之前一樣，先搜索，導入歷史。 可以看到，這個范例中一共有20條記錄，找到第20條記錄Circos Plot，點擊重新運行當前任務。 一.Karyotype 看一下5號文件Kary 閱讀全文